我被别人指示用攻击器攻击一个网站，我会被抓吗

基本不可能。

如果你的攻击器是使用自己的宽带攻击网站的话，一般民用的上传带宽根本无法对网站造成影响。这点攻击可以无视。

如果你的攻击器使用的是开发者嵌入的肉鸡来攻击的话，网站后台能查到的也就是肉鸡的IP地址，根本查不到你。

入侵别人的网站会被网警查吗？

不要出现重大的网络问题或公共危害问题，没人有那心思去理你的。就是理，也只是禁止不会捉人。